Согласно местной легенде, храм Танах Лот в начале 16-го века основал странствующий индуистский брахман-яванец Ниратха. Ниратхе было видение, что это место священно и должно стать местом поклонения морским богам. Храм построен в виде пагоды, символизирующей священную гору Меру - обитель богов. Стражи храма - священные морские змеи, яд которых в 3 раза сильнее яда кобры, однако, как говорят местные жители, змеям ни разу не приходилось пускать свои зубы в ход, т.к. ни злые духи, ни непрошенные гости даже не пытались осквернить святыню. Туристы, отправляющиеся на Бали и мечтающие сделать фото на память внутри храма Танах Лот, должны будут довольствоваться фотографиями на фоне храма, т.к. в храм пускают только индуистов. Поскольку священные змеи живут не в самом храме, а в пещере у подножия скалы, то туристы могут воочию увидеть этих грозных стражей. Также туристы могут посетить другую пещеру у подножия скалы, где бъёт родник с пресной водой. Эта вода считается верующими целебной.

В 1980 году скала, на которой стоит Пура Танах Лот, начала рушиться, и правительство Японии выделило Индонезии кредит в размере 130 миллионов долларов на сохранение уникального храма. Сейчас треть скалы является искусственно созданной.